More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1459 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  100 
 
 
770 aa  1574    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  49.41 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  48.83 
 
 
640 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  48.84 
 
 
628 aa  479  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
797 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  41.63 
 
 
549 aa  399  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  43.34 
 
 
547 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  41.47 
 
 
558 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  41.11 
 
 
654 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  40.91 
 
 
749 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  42.89 
 
 
591 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  40.47 
 
 
682 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.83 
 
 
583 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
551 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
609 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  40.64 
 
 
542 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
556 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  40.24 
 
 
791 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
545 aa  352  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  44.63 
 
 
991 aa  348  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  44.39 
 
 
1255 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  42.45 
 
 
1319 aa  331  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  43.11 
 
 
847 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  40.76 
 
 
1335 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  42 
 
 
831 aa  319  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  38.14 
 
 
722 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
510 aa  293  8e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
519 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
612 aa  276  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  32.59 
 
 
671 aa  271  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  36.27 
 
 
610 aa  251  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
547 aa  250  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  35.88 
 
 
604 aa  247  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
617 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
622 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
512 aa  241  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  36.58 
 
 
620 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
513 aa  233  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
546 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  35.06 
 
 
546 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.17 
 
 
559 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  33.18 
 
 
546 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.01 
 
 
549 aa  227  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
492 aa  227  7e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.32 
 
 
546 aa  226  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.97 
 
 
489 aa  224  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
491 aa  223  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.41 
 
 
492 aa  223  8e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
557 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  32.13 
 
 
572 aa  220  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.67 
 
 
577 aa  213  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.06 
 
 
557 aa  211  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
557 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
552 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
557 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.66 
 
 
548 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
552 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
553 aa  189  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
553 aa  189  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
553 aa  189  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
553 aa  189  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
544 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.87 
 
 
476 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
311 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.61 
 
 
447 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  32.61 
 
 
455 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
450 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
450 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.88 
 
 
454 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
450 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
463 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  32.09 
 
 
447 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.09 
 
 
447 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.09 
 
 
447 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
440 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  32.09 
 
 
446 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.07 
 
 
447 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
521 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.49 
 
 
438 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.32 
 
 
467 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.91 
 
 
412 aa  151  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  32.65 
 
 
469 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  34.36 
 
 
472 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.51 
 
 
498 aa  150  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.66 
 
 
472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.25 
 
 
474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  32.36 
 
 
469 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  31.99 
 
 
423 aa  149  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  30.3 
 
 
462 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33.13 
 
 
634 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
440 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  32.11 
 
 
474 aa  146  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  34.14 
 
 
515 aa  146  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
438 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.23 
 
 
520 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.23 
 
 
520 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>