More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1342 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  100 
 
 
622 aa  1270    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  63.77 
 
 
620 aa  805    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  52.37 
 
 
610 aa  635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  72.3 
 
 
617 aa  932    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  75.04 
 
 
618 aa  975    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  47.01 
 
 
604 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  40.28 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
546 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
546 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  40.24 
 
 
546 aa  405  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  50 
 
 
512 aa  398  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  38.97 
 
 
549 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  46.94 
 
 
513 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
547 aa  385  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
543 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  36.14 
 
 
557 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
557 aa  353  4e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.91 
 
 
559 aa  349  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.14 
 
 
557 aa  347  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.49 
 
 
557 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  37.85 
 
 
547 aa  299  9e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
628 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
609 aa  289  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  36.61 
 
 
654 aa  281  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
671 aa  280  5e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
831 aa  280  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  40.05 
 
 
682 aa  279  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
749 aa  279  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
551 aa  276  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  36.81 
 
 
791 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  39.89 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
1255 aa  272  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  41.91 
 
 
847 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
545 aa  271  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  41.85 
 
 
1335 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
549 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  38.87 
 
 
556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  41.64 
 
 
797 aa  267  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  41.06 
 
 
640 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  36.95 
 
 
542 aa  263  6e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
1319 aa  263  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  38.77 
 
 
692 aa  261  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  40.54 
 
 
591 aa  261  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
549 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.68 
 
 
583 aa  258  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
722 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  34.15 
 
 
510 aa  252  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36 
 
 
519 aa  246  6.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  37.37 
 
 
770 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  34.77 
 
 
991 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.65 
 
 
612 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
577 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  34.2 
 
 
572 aa  206  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
492 aa  203  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.67 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  37 
 
 
491 aa  200  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29.85 
 
 
489 aa  183  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
548 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.67 
 
 
552 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
473 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.67 
 
 
552 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.91 
 
 
544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
553 aa  161  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
553 aa  161  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
553 aa  161  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
553 aa  161  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
412 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  32.69 
 
 
311 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
452 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
450 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.32 
 
 
444 aa  158  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.44 
 
 
476 aa  157  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
440 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
438 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
449 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  29.06 
 
 
483 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
411 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
463 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
478 aa  152  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
463 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
445 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  32.2 
 
 
513 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.97 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  34.71 
 
 
445 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
492 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
466 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
498 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.74 
 
 
467 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  34.25 
 
 
504 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.31 
 
 
515 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.78 
 
 
432 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
487 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
417 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
452 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
639 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.16 
 
 
479 aa  144  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
491 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
454 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>