More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0439 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  100 
 
 
671 aa  1354    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  46.77 
 
 
519 aa  444  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
510 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  38.02 
 
 
654 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  41.55 
 
 
572 aa  326  7e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.25 
 
 
558 aa  324  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  37.58 
 
 
797 aa  323  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
791 aa  323  8e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
749 aa  317  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  41.81 
 
 
545 aa  315  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  41.75 
 
 
577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  36.43 
 
 
628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  37.73 
 
 
547 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
609 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
682 aa  312  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
542 aa  307  5.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  37.95 
 
 
556 aa  306  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
489 aa  303  9e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
549 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.08 
 
 
640 aa  297  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.58 
 
 
604 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  35.91 
 
 
551 aa  294  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  38.44 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
591 aa  283  9e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  38.19 
 
 
847 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.13 
 
 
617 aa  279  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  40.27 
 
 
831 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
692 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
991 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.38 
 
 
583 aa  278  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  33.9 
 
 
547 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
1255 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  35.93 
 
 
1319 aa  272  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  31.49 
 
 
770 aa  273  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
622 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  35.01 
 
 
722 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
1335 aa  269  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.87 
 
 
618 aa  269  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
546 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  38.64 
 
 
549 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
491 aa  264  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  38.72 
 
 
546 aa  260  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
546 aa  260  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  37.02 
 
 
492 aa  259  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  39.1 
 
 
512 aa  257  4e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.69 
 
 
492 aa  257  5e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  38.19 
 
 
543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
557 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
612 aa  250  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
557 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
620 aa  247  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  40 
 
 
513 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
557 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.52 
 
 
557 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.56 
 
 
473 aa  225  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
476 aa  225  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
515 aa  224  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.5 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  32.76 
 
 
552 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.06 
 
 
552 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
311 aa  210  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
553 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
553 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
553 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
553 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
483 aa  187  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
544 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
478 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  34.67 
 
 
468 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.25 
 
 
476 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  33.07 
 
 
465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
485 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.51 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.82 
 
 
463 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
482 aa  164  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
477 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
492 aa  161  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  34.03 
 
 
513 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
445 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
472 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
504 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
500 aa  160  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
417 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  32.22 
 
 
483 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
508 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
521 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
480 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  36.47 
 
 
449 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
440 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
485 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
491 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
428 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.93 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>