More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2568 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  100 
 
 
557 aa  1146    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  68.12 
 
 
559 aa  784    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  78.1 
 
 
557 aa  906    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  75.86 
 
 
557 aa  882    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  76.48 
 
 
557 aa  877    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  50.92 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  50.55 
 
 
546 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  50.37 
 
 
546 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  50.18 
 
 
546 aa  561  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  50.37 
 
 
547 aa  536  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  47.97 
 
 
543 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
617 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.68 
 
 
604 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.1 
 
 
618 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  36.93 
 
 
610 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
622 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
513 aa  349  6e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
512 aa  346  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
547 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
510 aa  278  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  33.6 
 
 
609 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
682 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
749 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
551 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
797 aa  260  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
791 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
831 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
654 aa  259  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
847 aa  258  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
545 aa  253  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
671 aa  253  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  34.8 
 
 
692 aa  250  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
1255 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  32.2 
 
 
558 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  33.62 
 
 
549 aa  243  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  33.94 
 
 
556 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  36.88 
 
 
1335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  36.62 
 
 
1319 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
722 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.26 
 
 
492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.26 
 
 
492 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  34.68 
 
 
542 aa  233  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.97 
 
 
991 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
491 aa  230  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  32.28 
 
 
583 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
640 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
591 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
519 aa  226  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  35.32 
 
 
612 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  31.99 
 
 
770 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.69 
 
 
489 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.19 
 
 
572 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  38.11 
 
 
311 aa  188  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
440 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
553 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
553 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
553 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
553 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  34.11 
 
 
552 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.05 
 
 
440 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.5 
 
 
515 aa  169  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.05 
 
 
438 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  33.7 
 
 
491 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
552 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.88 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35 
 
 
479 aa  163  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.36 
 
 
463 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
451 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
544 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
451 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
444 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  32 
 
 
482 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.84 
 
 
472 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  31.53 
 
 
483 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  32.75 
 
 
450 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
482 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  30.96 
 
 
491 aa  160  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  33.04 
 
 
449 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
485 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  31.23 
 
 
469 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  32.01 
 
 
482 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  30.95 
 
 
469 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.05 
 
 
450 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
449 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  32.82 
 
 
442 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  31.53 
 
 
485 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  30.12 
 
 
477 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.98 
 
 
476 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.14 
 
 
454 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.92 
 
 
491 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
476 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  33.96 
 
 
472 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>