More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2687 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  65.8 
 
 
640 aa  723    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  67.59 
 
 
628 aa  761    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  100 
 
 
549 aa  1134    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  50.19 
 
 
549 aa  525  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  50.51 
 
 
542 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  48.9 
 
 
558 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  49.41 
 
 
770 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  49.7 
 
 
556 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
654 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  48.1 
 
 
551 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  45.03 
 
 
682 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
797 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  44.81 
 
 
749 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  47.84 
 
 
591 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
791 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  46.07 
 
 
609 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  44.01 
 
 
547 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.64 
 
 
583 aa  388  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  46.35 
 
 
1255 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
1319 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  39.59 
 
 
545 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  40.92 
 
 
722 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  46.65 
 
 
847 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.02 
 
 
692 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  47.68 
 
 
1335 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
831 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
991 aa  362  9e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.72 
 
 
510 aa  349  8e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  42.09 
 
 
612 aa  319  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  38.87 
 
 
519 aa  319  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
671 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  39.1 
 
 
604 aa  286  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
512 aa  276  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
547 aa  273  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  37.18 
 
 
549 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
610 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
513 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
492 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
492 aa  265  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  37.14 
 
 
617 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  37.57 
 
 
620 aa  264  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
491 aa  261  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
622 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.03 
 
 
618 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
489 aa  256  7e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
543 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
546 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  35.32 
 
 
546 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
557 aa  243  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
546 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.39 
 
 
559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
557 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
557 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33 
 
 
577 aa  229  8e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
572 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
552 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
548 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
552 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.15 
 
 
544 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
311 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
553 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
553 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
553 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
553 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.16 
 
 
473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.03 
 
 
515 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.9 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.5 
 
 
521 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
498 aa  166  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.09 
 
 
454 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  35.25 
 
 
423 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.19 
 
 
447 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
438 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  30.18 
 
 
447 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  30.18 
 
 
447 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  30.18 
 
 
447 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
504 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  32.29 
 
 
428 aa  156  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.19 
 
 
428 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.82 
 
 
594 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.19 
 
 
428 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  34.91 
 
 
452 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
417 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
442 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
428 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  30.94 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  30.94 
 
 
447 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
423 aa  153  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  29.88 
 
 
446 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  28.45 
 
 
438 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  28.93 
 
 
469 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
438 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>