More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1172 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  100 
 
 
640 aa  1316    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  65.48 
 
 
628 aa  685    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  65.8 
 
 
549 aa  723    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  50.96 
 
 
549 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  48.83 
 
 
770 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  44.3 
 
 
558 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  46.6 
 
 
542 aa  480  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
797 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  47.39 
 
 
556 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
654 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
791 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
749 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  46.51 
 
 
551 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  41.74 
 
 
609 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  45.74 
 
 
682 aa  458  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  45.49 
 
 
591 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  44.42 
 
 
547 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  44.95 
 
 
692 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
847 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  42.95 
 
 
991 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  42.45 
 
 
545 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
1255 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
1319 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.18 
 
 
583 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
831 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  40.2 
 
 
1335 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.12 
 
 
722 aa  356  7.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.33 
 
 
510 aa  341  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.27 
 
 
612 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.77 
 
 
519 aa  296  7e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.51 
 
 
671 aa  293  8e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.24 
 
 
604 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
617 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  38.99 
 
 
512 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
547 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  39.35 
 
 
610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  40.84 
 
 
618 aa  265  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
549 aa  263  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.12 
 
 
513 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
622 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
489 aa  257  4e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
620 aa  257  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.97 
 
 
543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
492 aa  246  8e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.97 
 
 
492 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.47 
 
 
546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
491 aa  244  5e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  35.59 
 
 
546 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
557 aa  240  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.35 
 
 
546 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
546 aa  237  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
559 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
552 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.83 
 
 
548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
557 aa  226  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
552 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.11 
 
 
544 aa  203  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
311 aa  188  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.76 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32 
 
 
515 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.12 
 
 
476 aa  163  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
440 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  31.41 
 
 
521 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.57 
 
 
498 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.85 
 
 
452 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.27 
 
 
438 aa  158  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.32 
 
 
454 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  30.49 
 
 
450 aa  153  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
440 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
639 aa  153  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  32.25 
 
 
442 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  30.27 
 
 
451 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  30.27 
 
 
451 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
455 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.58 
 
 
438 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.78 
 
 
447 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.45 
 
 
444 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
417 aa  150  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  31.42 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.33 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.8 
 
 
478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  31.42 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  31.42 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  33.63 
 
 
423 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.12 
 
 
446 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  27.55 
 
 
445 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.47 
 
 
594 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
563 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  28.01 
 
 
634 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  28.92 
 
 
467 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>