More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4555 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 343 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  81.52 
 
 		 342 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  81.6 
 
 		 340 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  76.29 
 
 		 343 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  57.98 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  50 
 
 		 330 aa  299  6e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  47.88 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.78 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  49.24 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  47.58 
 
 		 332 aa  278  9e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  39.38 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.8 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.36 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.61 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.14 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.77 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.22 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  37.69 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  37.38 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.27 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  36.31 
 
 		 361 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.31 
 
 		 372 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  32.71 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 466 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 467 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  37.22 
 
 		 515 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  37.22 
 
 		 521 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  37.22 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  37.22 
 
 		 523 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  37.22 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  37.22 
 
 		 523 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  37.22 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 472 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 472 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.54 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.63 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  34.63 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  36.31 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 474 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  34.49 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  34.49 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 462 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.32 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  35.58 
 
 		 444 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  34.12 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  30.22 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  29.91 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 487 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 469 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  37.22 
 
 		 428 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 440 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.97 
 
 		 478 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 442 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  34.71 
 
 		 450 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.97 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.88 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  35.58 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 452 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 477 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 452 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  34.18 
 
 		 432 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.01 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 521 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.78 
 
 		 438 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.38 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.38 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.23 
 
 		 451 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  33.75 
 
 		 469 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 462 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.65 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  37.54 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>