More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0173 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0173  type II secretion system protein E  100 
 
 		 368 aa  744    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.579319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  33.98 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  34.3 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  34.31 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 548 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  31.14 
 
 		 520 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 520 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  30.52 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  33.05 
 
 		 561 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 832 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  30.14 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 569 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  29.88 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  33.04 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  32.81 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  31.13 
 
 		 514 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  31.87 
 
 		 521 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  29.13 
 
 		 469 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  29.11 
 
 		 568 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 888 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  33.83 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  27.03 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  27.03 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  28.17 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  29.77 
 
 		 566 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  28.83 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  30.37 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  32 
 
 		 559 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  30.77 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  26.77 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  26.77 
 
 		 461 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  28.18 
 
 		 557 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 885 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0392  putative type II protein secretion system E protein CtsE  31.09 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  28.86 
 
 		 561 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  28.86 
 
 		 891 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  30.46 
 
 		 520 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.36 
 
 		 577 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 538 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 571 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  32.49 
 
 		 583 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 565 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  31.42 
 
 		 558 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  27.79 
 
 		 693 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  27.79 
 
 		 693 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  30.41 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  29.28 
 
 		 507 aa  146  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  26.58 
 
 		 568 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  31.96 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  28.09 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  29.31 
 
 		 577 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  28.19 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1163  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 782 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  29.23 
 
 		 493 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  31.65 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  28.5 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  28.45 
 
 		 579 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 574 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  28.96 
 
 		 567 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  29.23 
 
 		 493 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  27.89 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  29.23 
 
 		 493 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  27.61 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  28.5 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  30.61 
 
 		 574 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 546 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  29.23 
 
 		 493 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 566 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  29.23 
 
 		 493 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  29.84 
 
 		 569 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  27.61 
 
 		 461 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  27.61 
 
 		 461 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 477 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 564 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 778 aa  142  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  29.52 
 
 		 571 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  28.92 
 
 		 778 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  29.67 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 626 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  28.25 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  27.61 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 585 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  29.67 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  28.02 
 
 		 549 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 688 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 561 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  30.61 
 
 		 573 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  26.51 
 
 		 505 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>