More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5248 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  100 
 
 		 368 aa  751    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  91.43 
 
 		 369 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  45.86 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  45.86 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  44.73 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  44.73 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  46.01 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  45.71 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  44.73 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  44.73 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  44.21 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  46.01 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  37.99 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  39.19 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  39.19 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  40.75 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  38.41 
 
 		 403 aa  182  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  36.31 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  37.73 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  35.35 
 
 		 396 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  39.85 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  40.66 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  37.19 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  38.46 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  34.53 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  40.3 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  34.44 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  40.66 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  38.21 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  36.2 
 
 		 388 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  38.31 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  38.31 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  38.57 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  38.06 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  35.49 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  38.77 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  38.93 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  37.06 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  36.7 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  33.63 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  41.11 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  37.55 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  32.79 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  37.41 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  44.1 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  37.08 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  44.1 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  34.86 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  34.86 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  35.24 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  35.44 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  36.43 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  44.55 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  36.69 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  31.85 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  37.59 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  34.46 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  38.3 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  32.14 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  40.74 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0043  twitching motility protein  37.35 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  31.88 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  36.45 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  35.58 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  31.94 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  37.08 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  33.03 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  42.56 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  37.26 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  32.72 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  37.86 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  31.64 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  37.64 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  36.63 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  39.81 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  39.81 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  40.25 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  36.74 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  39.01 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  31.53 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  39.92 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  39.93 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  41.12 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  35.74 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  35.74 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  36.26 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  37.32 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  39.17 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  43.92 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  39.81 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  33.55 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  41.06 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  33.55 
 
 		 373 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  36.59 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  41.59 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  42.18 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  33.94 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  33.43 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  44.39 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  44.63 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>