More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5443 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  89.43 
 
 		 368 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  100 
 
 		 369 aa  753    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  45.99 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  45.99 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  44.96 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  44.96 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  45.54 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  45.54 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  44.96 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  44.96 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 367 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  45.54 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  39.62 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  35.95 
 
 		 367 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  37.59 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  40.23 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  38.41 
 
 		 396 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  37.46 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  36.24 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  40.75 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  43.93 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  34.9 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  37.5 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  37.5 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  38.19 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  36.97 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  32.92 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  45.19 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  33.33 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  38.17 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  43.36 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  38.99 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  37.59 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  40.51 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  32.49 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  34.78 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  41.6 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  35.05 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  36.57 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  32.24 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  36.47 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  38.35 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  36.47 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  35.98 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  31.94 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  39.83 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  34.5 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  40.57 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  35.53 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  38.43 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  42.98 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  35.15 
 
 		 347 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  33.03 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  43.59 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  32.82 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  38.4 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  32.84 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  31.94 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  43.59 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  36.62 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  34.34 
 
 		 374 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  32.83 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  35.13 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  30.86 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  36.05 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  36.73 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  33.82 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  35.79 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  36.78 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  34.91 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  30.42 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  36.26 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  32.72 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  35.36 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  33.94 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  33.13 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  37.45 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  35.09 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  37.94 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  42.42 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  36.23 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  35.09 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  35.88 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  36.23 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  35.09 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  41.47 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  35.91 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  32.24 
 
 		 358 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  39.74 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0043  twitching motility protein  36.33 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  37.4 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  32.85 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  35.71 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  32.85 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  40.28 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  48.59 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  34.63 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  35.79 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  46.63 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  41.06 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>