More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4170 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  100 
 
 		 343 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  75.29 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  76.92 
 
 		 340 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  76.22 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  56.66 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.78 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  47.81 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  46.91 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  46.65 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  47.19 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  40.06 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 342 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.75 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.27 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.19 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.01 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  38.32 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.8 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.11 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.19 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  38.21 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  38.26 
 
 		 515 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  38.26 
 
 		 521 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  38.26 
 
 		 520 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  38.26 
 
 		 520 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  38.26 
 
 		 520 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  38.26 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.26 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.86 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  38.26 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.61 
 
 		 372 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 472 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  34.93 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  34.94 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  34.33 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.97 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  33.44 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  33.64 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  35.71 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  35.71 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.66 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  32.4 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  36.31 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.86 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 469 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.86 
 
 		 487 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  37.22 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 477 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 488 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  37.03 
 
 		 463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 474 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.83 
 
 		 468 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.65 
 
 		 572 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 521 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.18 
 
 		 441 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  35.15 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  34.18 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  38.57 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  36.98 
 
 		 433 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  37.34 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 482 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  37.26 
 
 		 484 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 482 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 463 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  35.69 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.93 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  35.78 
 
 		 477 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.48 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>