More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0477 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  100 
 
 
396 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  56.98 
 
 
387 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  60.12 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  55.75 
 
 
396 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  55.58 
 
 
415 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  53.11 
 
 
389 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50.52 
 
 
432 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  55.07 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  57.14 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  52.46 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.63 
 
 
383 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  56.13 
 
 
398 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  57.1 
 
 
401 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  56.97 
 
 
390 aa  295  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  55.15 
 
 
388 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  55.75 
 
 
395 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  55.15 
 
 
388 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  54.6 
 
 
388 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.72 
 
 
378 aa  292  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  54.9 
 
 
389 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  58.65 
 
 
401 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  54.21 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  56.95 
 
 
405 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  55.91 
 
 
412 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  56.35 
 
 
352 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  59.76 
 
 
400 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  55.18 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.63 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  54.91 
 
 
393 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  48.48 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  50.4 
 
 
492 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  57.85 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  52.2 
 
 
393 aa  256  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  52.37 
 
 
422 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  52.66 
 
 
514 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  38.16 
 
 
488 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
467 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  38.33 
 
 
433 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  37.05 
 
 
491 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
484 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  38.16 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  37.05 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  40.51 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  39.33 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  38.33 
 
 
500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  37.88 
 
 
492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
482 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
464 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  39.28 
 
 
453 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
483 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
485 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
489 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  37.33 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  37.33 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
508 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
472 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  37.33 
 
 
485 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
480 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
488 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  37.88 
 
 
482 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
454 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
454 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
454 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  40.4 
 
 
454 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  43.92 
 
 
455 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  41.99 
 
 
462 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  44.88 
 
 
449 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  42.35 
 
 
445 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
624 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  39.74 
 
 
472 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  42.03 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.06 
 
 
479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
463 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  39.94 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  40.51 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  36.93 
 
 
463 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
477 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.03 
 
 
460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
473 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  42.42 
 
 
416 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  36.07 
 
 
504 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
487 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  40 
 
 
428 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
478 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.12 
 
 
455 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  38.04 
 
 
442 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  44.33 
 
 
474 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  41.58 
 
 
459 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  40.69 
 
 
594 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  39.78 
 
 
492 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  39.6 
 
 
423 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  39.39 
 
 
456 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  44.09 
 
 
639 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
444 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.63 
 
 
455 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>