More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0248 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  100 
 
 		 343 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  62.58 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  57.99 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  56.92 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  55.69 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  55.49 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  46.55 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.15 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.69 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  48.17 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  45.79 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  47.87 
 
 		 362 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  44.62 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.08 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.49 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  40.57 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.81 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  39.58 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  42.41 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  42.01 
 
 		 372 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.38 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  41.42 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.12 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  37.5 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.83 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.79 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.87 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  40.19 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  38.97 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  37.31 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  40.24 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  39.05 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  39.05 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.94 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  35.6 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.99 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  36.22 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  35.91 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.42 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.45 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  37.84 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.25 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.35 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  35.33 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.71 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  36.54 
 
 		 594 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  36.34 
 
 		 563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.07 
 
 		 638 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 569 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.02 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.02 
 
 		 634 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 		 572 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 474 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 444 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  33.53 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  32.37 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  32.37 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  32.37 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  32.37 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 473 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  32.37 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.72 
 
 		 589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  32.37 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  32.37 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.41 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 639 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 411 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 467 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 472 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  32.9 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  31.95 
 
 		 491 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  33.21 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  32.04 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  32.27 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  31.95 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.27 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.53 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 467 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 482 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.09 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>