More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a019 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  100 
 
 		 333 aa  686    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  72.26 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  53.33 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  48.56 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  48.24 
 
 		 361 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.03 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  47.94 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  42.9 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.85 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.65 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  38.56 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.36 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.45 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  39.1 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  37.31 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.28 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  38.49 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.24 
 
 		 383 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.38 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.61 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  36.18 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.31 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.61 
 
 		 372 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  34.85 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  34.72 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  35.95 
 
 		 379 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  34.85 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  33.83 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.86 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  35.58 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.33 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.48 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.07 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.97 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  30.65 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.49 
 
 		 589 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.96 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 440 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  28.25 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  31.75 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.82 
 
 		 572 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.14 
 
 		 634 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.97 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  28.48 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  31.49 
 
 		 638 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  30.52 
 
 		 569 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  28.62 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.43 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.19 
 
 		 594 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  30.84 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  34.2 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 449 aa  152  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 472 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.48 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 500 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 491 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 639 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 477 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  32.41 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.05 
 
 		 467 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 508 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 479 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.82 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.41 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.31 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  29.14 
 
 		 474 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 476 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.55 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 477 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  28.31 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 462 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  28.31 
 
 		 521 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  27.19 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  28.31 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  28.83 
 
 		 520 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  28.83 
 
 		 520 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  28.83 
 
 		 520 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  28.31 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>