More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08204 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  100 
 
 		 338 aa  706    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  55.79 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  49.4 
 
 		 353 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  48.36 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.65 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  42.77 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.49 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.41 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.94 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.5 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.67 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.92 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  39.38 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.2 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.87 
 
 		 382 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  38.27 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.87 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.44 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  37.83 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.9 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  34.18 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  36.79 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.74 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.73 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  33.85 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  35.22 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.52 
 
 		 383 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  35.14 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  34.55 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  34.86 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.86 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  36.91 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  36.22 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  37 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  34.56 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  35.14 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  36.04 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.91 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  32.03 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  32.92 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.67 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.99 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.86 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  29.14 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  30.27 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.36 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 440 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  32.47 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  28.39 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  30.07 
 
 		 589 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  29.21 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  28.3 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 459 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.61 
 
 		 453 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.04 
 
 		 473 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  29.12 
 
 		 515 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  28.62 
 
 		 441 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  28.39 
 
 		 521 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  28.39 
 
 		 523 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  28.39 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  28.39 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  28.39 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  28.39 
 
 		 523 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  31.9 
 
 		 408 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  29.32 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  27.99 
 
 		 638 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 639 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.61 
 
 		 594 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  28.75 
 
 		 478 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 456 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.52 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.52 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  27.85 
 
 		 572 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 479 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  32.66 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  30.38 
 
 		 454 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.93 
 
 		 454 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  29.11 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  30.61 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  30.61 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  30.61 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 460 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  31 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>