More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0740 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  100 
 
 
331 aa  672    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  68.83 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  67.58 
 
 
330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  68.9 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  49.24 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  46.65 
 
 
343 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  47.69 
 
 
342 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  46.77 
 
 
340 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
344 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  43.61 
 
 
342 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.56 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.42 
 
 
368 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  42.77 
 
 
361 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.03 
 
 
349 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  40.57 
 
 
343 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.35 
 
 
337 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  42.22 
 
 
334 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.88 
 
 
383 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.33 
 
 
347 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  41.9 
 
 
334 aa  228  9e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.05 
 
 
375 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  38.81 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  40.52 
 
 
352 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  40.52 
 
 
352 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.46 
 
 
362 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.52 
 
 
382 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  38.41 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  37.78 
 
 
372 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.41 
 
 
372 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
569 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.95 
 
 
357 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
572 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  34.85 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  37.1 
 
 
440 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  36.86 
 
 
589 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.67 
 
 
342 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  36.51 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.5 
 
 
355 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  37.82 
 
 
638 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
338 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  37.18 
 
 
634 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  32.51 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
624 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
463 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  36.22 
 
 
563 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
474 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
472 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
455 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
472 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.23 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
444 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  32.72 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  35.81 
 
 
428 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  35.81 
 
 
442 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
442 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  35.81 
 
 
428 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  35.81 
 
 
428 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
472 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
639 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.74 
 
 
468 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  35.17 
 
 
521 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  35.17 
 
 
515 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  35.17 
 
 
520 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  35.17 
 
 
520 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  35.17 
 
 
523 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  35.17 
 
 
520 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  35.17 
 
 
523 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.56 
 
 
474 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
347 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  36.2 
 
 
328 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
498 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
465 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
463 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
478 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  33.66 
 
 
449 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.29 
 
 
441 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  36.18 
 
 
423 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  35.41 
 
 
608 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
349 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
349 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  35.58 
 
 
428 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  33.33 
 
 
344 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
328 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  36.19 
 
 
466 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  35.6 
 
 
458 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
478 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  33.65 
 
 
594 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.31 
 
 
328 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
328 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
467 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.37 
 
 
521 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
467 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
487 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  33.84 
 
 
483 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  36.51 
 
 
423 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.87 
 
 
438 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  34.52 
 
 
488 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>