More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1145 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 
355 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
338 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  42.49 
 
 
343 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.53 
 
 
339 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  40.58 
 
 
361 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.23 
 
 
368 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  42.15 
 
 
342 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.8 
 
 
347 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  39.06 
 
 
361 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.01 
 
 
345 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.78 
 
 
362 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  38.28 
 
 
344 aa  222  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.35 
 
 
337 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.31 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.58 
 
 
353 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.39 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.76 
 
 
334 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  36.41 
 
 
372 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.49 
 
 
372 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  38.11 
 
 
379 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.99 
 
 
382 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  35.42 
 
 
372 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  34.5 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.74 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.96 
 
 
375 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  32.33 
 
 
333 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  35.49 
 
 
391 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  32.74 
 
 
332 aa  186  7e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  37.75 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  32.45 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  34.69 
 
 
355 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  34.89 
 
 
346 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.74 
 
 
342 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  35.82 
 
 
344 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  36.99 
 
 
349 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  32.15 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.08 
 
 
349 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  32.14 
 
 
334 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  29.39 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.85 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  31.05 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  29.5 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.03 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  28.91 
 
 
342 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.26 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  28.18 
 
 
328 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  28.23 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  32.99 
 
 
440 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  29.1 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  29.1 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.4 
 
 
411 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  32.76 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
376 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  29.31 
 
 
488 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.42 
 
 
482 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
483 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  31.42 
 
 
490 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  27.62 
 
 
455 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.12 
 
 
467 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  31.72 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
563 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  31.12 
 
 
433 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
349 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.91 
 
 
466 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
482 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.61 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
467 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
485 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.7 
 
 
482 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  31.89 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  31.12 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.83 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  30.68 
 
 
349 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  29.11 
 
 
458 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.19 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  38.42 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  36.16 
 
 
572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  25.62 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  30.82 
 
 
520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30.82 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  30.82 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  28.4 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  29.31 
 
 
477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  30.82 
 
 
520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.82 
 
 
639 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>