More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0685 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 
333 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  68.5 
 
 
337 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  68.6 
 
 
344 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  55.49 
 
 
343 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  52.29 
 
 
342 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  50.93 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  46.48 
 
 
361 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.28 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.23 
 
 
347 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  45.45 
 
 
382 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  42.9 
 
 
332 aa  255  6e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  43.56 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  42.24 
 
 
330 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  45.39 
 
 
361 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  45.05 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.82 
 
 
375 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  38.62 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.25 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.29 
 
 
357 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  41.96 
 
 
332 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.01 
 
 
383 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.12 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  39.44 
 
 
346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  38.17 
 
 
340 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.8 
 
 
343 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.44 
 
 
342 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  38.37 
 
 
355 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  41.18 
 
 
379 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  39.32 
 
 
372 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  40.45 
 
 
333 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
349 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  38.83 
 
 
352 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  38.83 
 
 
352 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  36.22 
 
 
344 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.39 
 
 
355 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.54 
 
 
339 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  35.29 
 
 
334 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  38.61 
 
 
330 aa  202  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  34.98 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.02 
 
 
349 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.01 
 
 
328 aa  195  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.17 
 
 
345 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
347 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  37.86 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.25 
 
 
349 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.76 
 
 
353 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
474 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
472 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
472 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.03 
 
 
523 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.03 
 
 
521 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.03 
 
 
515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.03 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  33.03 
 
 
523 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.03 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.03 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  34.7 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
455 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 
572 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.44 
 
 
569 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  34.85 
 
 
423 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
442 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  34.6 
 
 
589 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
482 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
487 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  32.8 
 
 
441 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
483 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
444 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
445 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.97 
 
 
477 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.43 
 
 
453 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
430 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
466 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
455 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  32.79 
 
 
464 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
476 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
482 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
492 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
482 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  32.9 
 
 
462 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34.18 
 
 
594 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
454 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
455 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
485 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
423 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  32.69 
 
 
482 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
482 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  34.73 
 
 
333 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  32.79 
 
 
459 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
472 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  32.37 
 
 
433 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.48 
 
 
472 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
489 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.6 
 
 
442 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
634 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>