More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2445 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 347 aa  725    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  48.14 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  48.01 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.23 
 
 		 333 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  45.57 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  45.2 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  46.74 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.39 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  41.69 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  42.28 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.98 
 
 		 334 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.83 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  38.85 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  40.85 
 
 		 332 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.14 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.32 
 
 		 342 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.19 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.8 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  38.61 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  40.33 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  39.04 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  39.04 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  40.77 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  40.85 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  40.48 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.18 
 
 		 375 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  38.99 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.54 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  40.26 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.81 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.22 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.31 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  36.83 
 
 		 338 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  35.44 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.98 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.85 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.37 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  34.5 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.28 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  34.28 
 
 		 344 aa  185  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.12 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  33.85 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 472 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.09 
 
 		 634 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  32.12 
 
 		 515 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 465 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  32.01 
 
 		 521 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  32.01 
 
 		 520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  32.01 
 
 		 520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  32.01 
 
 		 520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  32.01 
 
 		 523 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.26 
 
 		 569 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 483 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.22 
 
 		 412 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.51 
 
 		 440 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 463 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 482 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.8 
 
 		 523 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  31.78 
 
 		 638 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.93 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  31.19 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.31 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.38 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34.07 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.37 
 
 		 624 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 482 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  30.53 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.38 
 
 		 467 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 490 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  32.92 
 
 		 487 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 500 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  30.95 
 
 		 589 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 476 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 478 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  32.35 
 
 		 560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  31.25 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 474 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  29.94 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.75 
 
 		 488 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 477 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  33.53 
 
 		 568 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.94 
 
 		 438 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>