More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3530 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  100 
 
 		 355 aa  721    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  63.45 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  64.2 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  45.79 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  43.5 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.83 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.37 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.18 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.2 
 
 		 361 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.71 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.44 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  35.51 
 
 		 361 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.23 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  35.99 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.61 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.54 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  32.72 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  36.22 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.69 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  31.61 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.86 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.24 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  32.41 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  31.89 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  36.39 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.79 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.25 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  29.91 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  31.97 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.53 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  32.62 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.74 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.96 
 
 		 342 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  30.49 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  35.43 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  31.48 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.88 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  28.48 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.94 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  33.83 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.23 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.47 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  28.71 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 349 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 349 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.15 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.69 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.87 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  31.91 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 473 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  30.39 
 
 		 428 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  30.39 
 
 		 428 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 428 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.12 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.61 
 
 		 472 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  32.47 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.93 
 
 		 451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  30.59 
 
 		 456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  29.04 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31 
 
 		 491 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 462 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 472 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.9 
 
 		 453 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  31.27 
 
 		 450 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 479 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 474 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 444 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.92 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 469 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  30 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  31.94 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  29.68 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.68 
 
 		 438 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  29.68 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  29.68 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  29.68 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  30 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.83 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.74 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>