More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0059 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  100 
 
 		 361 aa  749    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  99.72 
 
 		 362 aa  748    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  72.43 
 
 		 357 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  50.45 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  49.56 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  50.16 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  51.9 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.87 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  45.45 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  48.17 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.52 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.14 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.69 
 
 		 333 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  46.28 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.71 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  40.28 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.04 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.04 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.06 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.95 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  39.89 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.23 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  40.82 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  37.97 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  37.97 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  39.62 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  37.77 
 
 		 331 aa  229  8e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  36.75 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.68 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.09 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.74 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  36.5 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  35.24 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  35.8 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  35.4 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  41.2 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  33.85 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.97 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.38 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  33.64 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  33.84 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  34.14 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.23 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.57 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 478 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  35.62 
 
 		 563 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.88 
 
 		 474 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 454 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  32.74 
 
 		 487 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.44 
 
 		 520 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.44 
 
 		 520 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.44 
 
 		 520 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.44 
 
 		 521 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  33.44 
 
 		 523 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.02 
 
 		 523 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 479 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.02 
 
 		 515 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 		 572 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  33.85 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34 
 
 		 594 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  31.29 
 
 		 569 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.21 
 
 		 638 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33.66 
 
 		 634 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.23 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 456 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  32.39 
 
 		 455 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  31.96 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  32.39 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 455 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.83 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 478 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 639 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 491 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.22 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>