More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0024 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 353 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  50.89 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  49.4 
 
 		 338 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  48.34 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.52 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.58 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  37 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.31 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.7 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.05 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.71 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  36.34 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.68 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.32 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.76 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  35.35 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  35.61 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  33.54 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.01 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.53 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  34.53 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.14 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  33.54 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.96 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  34.53 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  35.1 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  32.26 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  32.26 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  33.53 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.93 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.52 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  34.89 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  32.57 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  33.62 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  30.96 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  35.2 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  33.93 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.23 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  32.67 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.23 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.37 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.2 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.52 
 
 		 440 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.05 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 411 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  29.66 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.11 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  29.63 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.22 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.22 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  30.9 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.22 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 491 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 488 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 487 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 474 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 472 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.18 
 
 		 639 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  30.39 
 
 		 521 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  31.32 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  30.39 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  29.82 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  30 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  30.39 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  30.39 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.62 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  30.39 
 
 		 523 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30.39 
 
 		 515 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 632 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  30.39 
 
 		 523 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.05 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  28.43 
 
 		 445 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 632 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 478 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  29.22 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  30.46 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.33 
 
 		 572 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 485 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.71 
 
 		 477 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 491 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.66 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 478 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30 
 
 		 462 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.47 
 
 		 445 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>