More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8218 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  100 
 
 		 344 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  81.34 
 
 		 346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  64.2 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  42.41 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.43 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.2 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.22 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.1 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.13 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.56 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.28 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  31.06 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  32.4 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.75 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  33.33 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  33.74 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.82 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  30.7 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.43 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.5 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.22 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  32.19 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  35.03 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.17 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.33 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  32.57 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.53 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  33.05 
 
 		 372 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.2 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  28.25 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  30.13 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.21 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  30.33 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.84 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  34.71 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.8 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  33.89 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  29.84 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.24 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.21 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  29.24 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  31.76 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  30.06 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  32.85 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  33.99 
 
 		 450 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.11 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.61 
 
 		 444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.46 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.99 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.9 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 449 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 478 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.31 
 
 		 473 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  32.13 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.13 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.13 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  31.8 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.8 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 469 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 454 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 438 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 451 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 451 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.13 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 639 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  31.5 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.27 
 
 		 594 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  30.74 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.81 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  33.22 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  32.26 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  29.38 
 
 		 428 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 469 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  30.1 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>