More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5020 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  100 
 
 		 347 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  48.36 
 
 		 338 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.5 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  48.34 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  44.41 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.71 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  38.98 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.61 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.94 
 
 		 362 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  39.62 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  39.42 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.72 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.48 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  37.74 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  37.11 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  36.13 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.04 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.61 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  33.97 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.58 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  34.81 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.65 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.01 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.85 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  35.05 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  33.97 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.03 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.65 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  35.03 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  32.77 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  34.46 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  35.85 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.15 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  34.08 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  34.93 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.97 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  32.9 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  32.55 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  34.71 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.58 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  32.15 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  29.94 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  31.09 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.55 
 
 		 594 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  29.84 
 
 		 563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  27.78 
 
 		 515 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  27.78 
 
 		 520 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  27.78 
 
 		 520 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  27.78 
 
 		 520 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  27.78 
 
 		 521 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  27.78 
 
 		 523 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  27.78 
 
 		 523 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.36 
 
 		 488 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  28.96 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.9 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.18 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  29.11 
 
 		 474 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.94 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  30.32 
 
 		 492 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  26.79 
 
 		 454 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  31.05 
 
 		 476 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 508 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 483 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  29.28 
 
 		 455 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  32.75 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  29.28 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.04 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 482 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.16 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  28.9 
 
 		 634 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  29.94 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  27.83 
 
 		 624 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.24 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  29.73 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.67 
 
 		 450 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  27.8 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.07 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  27.95 
 
 		 457 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.43 
 
 		 484 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  28.66 
 
 		 589 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>