More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0016 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 339 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  55.79 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  50.89 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  46.5 
 
 		 347 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.29 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.53 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  34.86 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  38.31 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.54 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.44 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  35.74 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.44 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.98 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  34.89 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.15 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.61 
 
 		 357 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  36.45 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.67 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.97 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  35.92 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  36.51 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  34.95 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.43 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  37.23 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.58 
 
 		 349 aa  179  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.52 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  34.38 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  35.71 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  34.23 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  35.5 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  34.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.88 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.25 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.23 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  31.74 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  33.33 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  33.13 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.9 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.87 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  31.16 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.05 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  32.82 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  32.3 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  28.76 
 
 		 572 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.49 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.35 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  32.85 
 
 		 321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.43 
 
 		 487 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.74 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  34.3 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  28.19 
 
 		 569 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.34 
 
 		 460 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  32.08 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 454 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  28.1 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.37 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  28.67 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  31.53 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  29.47 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  29.79 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.16 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  32.9 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  28.82 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30 
 
 		 484 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  30 
 
 		 482 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 490 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  30.19 
 
 		 396 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1709  type II secretion system protein E  30 
 
 		 612 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  28.16 
 
 		 472 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.32 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.52 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  30.03 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  26.8 
 
 		 477 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.52 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 639 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.19 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  27.12 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  30 
 
 		 488 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.95 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  29.87 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  31.6 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>