More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1622 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 346 aa  705    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  43.03 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  43.03 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  41.37 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  42.14 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 321 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  41.07 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  41.76 
 
 		 323 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.87 
 
 		 310 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  39.29 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  40.95 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  43.03 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.74 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  40.65 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  41.25 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.19 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.65 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  41.54 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.19 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.78 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  39.07 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.31 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.27 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.95 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.58 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  38.68 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.3 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.67 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.57 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  37.84 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  39.27 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.51 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  41.32 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  38.41 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.37 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  40.42 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.94 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.02 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.02 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  42.19 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.37 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.52 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.58 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  43.12 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.52 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.43 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.94 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.56 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  38.81 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  39.81 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.25 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.32 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.32 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.74 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  38.02 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.67 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.63 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.15 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  33.75 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  33.75 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  30.57 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.42 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5468  type II secretion system protein E  34.71 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0233856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  33.57 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.52 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.29 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  31.66 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.42 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 416 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  28.7 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  32.34 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.22 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  30.51 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  30.51 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>