More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6497 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 372 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  86.52 
 
 		 372 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  82.75 
 
 		 372 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  80.5 
 
 		 375 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  79.94 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  70.25 
 
 		 383 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  72.01 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  72.01 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.69 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.25 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.3 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.71 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  41 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.19 
 
 		 347 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  40.83 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  40.23 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  40.23 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.94 
 
 		 362 aa  229  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.66 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  35.61 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  39.86 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  38.41 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  36.31 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  37.01 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.42 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  37.76 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.49 
 
 		 355 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.31 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.25 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  37.06 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.93 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  35.23 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.52 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  35.25 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  35.4 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.88 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  34.17 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.93 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  33.55 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  32.91 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.01 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.24 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.24 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.07 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.8 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.96 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.65 
 
 		 523 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.65 
 
 		 523 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.65 
 
 		 521 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  31.65 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.01 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  30 
 
 		 466 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.01 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  25.4 
 
 		 455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  29.77 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.36 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.13 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.14 
 
 		 572 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  30.45 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  30.96 
 
 		 487 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.64 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.62 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 468 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.32 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.42 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 463 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  29.87 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  28.81 
 
 		 569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.18 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  26.9 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  29.68 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  26.17 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  33.23 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  29.03 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>