More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6214 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 349 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  48.45 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  46.31 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  46.78 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  46.15 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  45.54 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  44.62 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  44.97 
 
 		 330 aa  266  5.999999999999999e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  44.17 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  43.03 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  41.69 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  37.94 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  37.06 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  38.01 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  37.69 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.94 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.02 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.35 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.17 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  35.07 
 
 		 333 aa  179  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.45 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 468 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  34.99 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  34.04 
 
 		 451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  34.13 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.83 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  33.12 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.01 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 463 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.08 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 624 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.89 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  32.53 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 455 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  34.01 
 
 		 560 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.28 
 
 		 569 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  34.99 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7229  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0403713  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  31.97 
 
 		 521 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 521 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.55 
 
 		 521 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  33.55 
 
 		 523 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.68 
 
 		 442 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.55 
 
 		 523 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  30.88 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  31.55 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.55 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.55 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.55 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.7 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.55 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.7 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.7 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  33.11 
 
 		 428 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.85 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.12 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  34.12 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  33.67 
 
 		 608 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5630  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 380 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00466879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.06 
 
 		 594 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 469 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.23 
 
 		 441 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.21 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 440 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  33.22 
 
 		 589 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.89 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  32.6 
 
 		 638 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.7 
 
 		 634 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  32.05 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.75 
 
 		 469 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  31.7 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.66 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.75 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.56 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>