More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0046 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 342 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  51.98 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  49.09 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  43.03 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  43.77 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  42.94 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.64 
 
 		 362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.47 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.25 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.32 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.44 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  38.73 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.27 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  34.65 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.07 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.22 
 
 		 383 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  38.99 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  34.24 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.26 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.15 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  33.03 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  33.67 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  37.34 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  37.34 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.54 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  37.22 
 
 		 372 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.77 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  33.54 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.32 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.25 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  33.54 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  38.08 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.77 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  35.6 
 
 		 372 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.74 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  33.44 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.54 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  32.71 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 391 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  30.94 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  31.21 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.65 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.46 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.76 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 474 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.47 
 
 		 467 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  30.7 
 
 		 569 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.95 
 
 		 432 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 472 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.85 
 
 		 572 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 463 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  30.31 
 
 		 521 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30.31 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  30.31 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  30.31 
 
 		 523 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.55 
 
 		 589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  30.31 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  30.31 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  30.31 
 
 		 523 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 487 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  30.25 
 
 		 638 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  30.03 
 
 		 634 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  29.88 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.51 
 
 		 594 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  29.94 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  29.14 
 
 		 438 aa  136  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 639 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.93 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  29.84 
 
 		 498 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  27.95 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  28.88 
 
 		 491 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  27.12 
 
 		 442 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 465 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  29.97 
 
 		 563 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 408 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  27.45 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  29.52 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  27.81 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  31.85 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>