More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1977 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  100 
 
 
343 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  100 
 
 
368 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  99.71 
 
 
343 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  97.67 
 
 
343 aa  685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  99.73 
 
 
368 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  100 
 
 
368 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  99.73 
 
 
368 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  69.3 
 
 
366 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  69.3 
 
 
366 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  64.27 
 
 
367 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
368 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
369 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  40.6 
 
 
356 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  36.71 
 
 
430 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  36.5 
 
 
372 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  40.77 
 
 
396 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  38.42 
 
 
358 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  36.53 
 
 
355 aa  202  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  35.41 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  34.1 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  36.13 
 
 
357 aa  197  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  38.08 
 
 
359 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  35.17 
 
 
362 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  35.19 
 
 
365 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  34.78 
 
 
358 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  38.91 
 
 
366 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  38.69 
 
 
366 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  39.93 
 
 
344 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  42.97 
 
 
377 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  35.63 
 
 
566 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  41.15 
 
 
339 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  39.33 
 
 
437 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0165  twitching motility protein  39.79 
 
 
360 aa  192  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.753648  normal  0.198553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  41.73 
 
 
432 aa  192  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  38.1 
 
 
347 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  33.52 
 
 
414 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  34.6 
 
 
365 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  39.49 
 
 
351 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  32.46 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  35.11 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  35.9 
 
 
360 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  35 
 
 
365 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  34.15 
 
 
370 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  37.02 
 
 
356 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  35.5 
 
 
358 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  38.2 
 
 
427 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  33.83 
 
 
360 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  34.6 
 
 
366 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  37.83 
 
 
427 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  37.02 
 
 
428 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  37.4 
 
 
431 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  37.83 
 
 
427 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  34.13 
 
 
351 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  36.76 
 
 
364 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  33.53 
 
 
360 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  34.6 
 
 
366 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  37.77 
 
 
370 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  43.97 
 
 
362 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  35.54 
 
 
445 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  34.6 
 
 
366 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  33.04 
 
 
360 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  43.91 
 
 
360 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  43.89 
 
 
403 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  35.54 
 
 
434 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  33.82 
 
 
365 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  36.64 
 
 
356 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  32.66 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  37.1 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  35.59 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  38.2 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  37.59 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  33.63 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  36.14 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  35.5 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  38.27 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  36.9 
 
 
352 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  33.43 
 
 
374 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  38.11 
 
 
382 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  37.32 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  38.31 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  36.86 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  34.15 
 
 
351 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  38.76 
 
 
352 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  37.5 
 
 
351 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  33.43 
 
 
360 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  37.32 
 
 
364 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  34.55 
 
 
357 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  35.64 
 
 
366 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  38.38 
 
 
368 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  33.43 
 
 
386 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  34.34 
 
 
365 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  38.2 
 
 
388 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  32.65 
 
 
360 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  33.24 
 
 
371 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  43.54 
 
 
398 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  37.24 
 
 
383 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  33.24 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  36.9 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  32.16 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  40.26 
 
 
383 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>