More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3428 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  100 
 
 		 436 aa  842    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  77.06 
 
 		 435 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  64.19 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  65.38 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  46.34 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  29.53 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  45.71 
 
 		 599 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  28.28 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  45.83 
 
 		 591 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  41.58 
 
 		 588 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  47.43 
 
 		 592 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  29.6 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  47.43 
 
 		 592 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  41.85 
 
 		 598 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  46.59 
 
 		 592 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  38.56 
 
 		 592 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  32.56 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  39.77 
 
 		 588 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  41.09 
 
 		 588 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  39.81 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.47 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  26.47 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  36.8 
 
 		 596 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  26.47 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  25.52 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  39.8 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  29.46 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  39.8 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  25.12 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  26.92 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  46.77 
 
 		 592 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  39.22 
 
 		 579 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  41.35 
 
 		 599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0158  putative transporter  26.68 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0784692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  43.01 
 
 		 588 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.86 
 
 		 624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  31.29 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  24.42 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  24.42 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  24.42 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  24.42 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  40.46 
 
 		 613 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  37.37 
 
 		 597 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  33.19 
 
 		 591 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  35.44 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  35.44 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  40.5 
 
 		 593 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  36.19 
 
 		 609 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  35.44 
 
 		 512 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  33.51 
 
 		 594 aa  123  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.96 
 
 		 588 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  36.19 
 
 		 612 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.93 
 
 		 589 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  38.12 
 
 		 609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  40.96 
 
 		 618 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  39.62 
 
 		 588 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  38.83 
 
 		 609 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  34.21 
 
 		 609 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  40.35 
 
 		 622 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 574 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  36.18 
 
 		 591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  33.33 
 
 		 574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  40.61 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  40.61 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  34.34 
 
 		 575 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  38.07 
 
 		 581 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  34.87 
 
 		 608 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  35.2 
 
 		 613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  36.71 
 
 		 589 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  42.68 
 
 		 588 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  40.91 
 
 		 609 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  39.29 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  33.33 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.04 
 
 		 618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  38.61 
 
 		 603 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  39.11 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  35.57 
 
 		 619 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  31.91 
 
 		 574 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  35.92 
 
 		 606 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  37.95 
 
 		 588 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  38.46 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  33.16 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.27 
 
 		 610 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 574 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  37 
 
 		 623 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  36.22 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  33.16 
 
 		 620 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  34.54 
 
 		 591 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  36.14 
 
 		 778 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  33.73 
 
 		 641 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  32.16 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  35.42 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>