More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3372 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  100 
 
 		 609 aa  1211    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  57.4 
 
 		 618 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  51.75 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  35.68 
 
 		 619 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 		 608 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  34.04 
 
 		 596 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  34.04 
 
 		 602 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.33 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  33.87 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.37 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.67 
 
 		 623 aa  273  7e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.03 
 
 		 599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.65 
 
 		 622 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.27 
 
 		 597 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.27 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.01 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.94 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 		 592 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 		 592 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.82 
 
 		 592 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.79 
 
 		 627 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.31 
 
 		 592 aa  251  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.99 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  31.81 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.81 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.93 
 
 		 591 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.46 
 
 		 605 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 		 588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.97 
 
 		 616 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.13 
 
 		 596 aa  233  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.5 
 
 		 589 aa  233  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.89 
 
 		 589 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.69 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.62 
 
 		 593 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.77 
 
 		 606 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.19 
 
 		 614 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.42 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.76 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.11 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 		 624 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.78 
 
 		 581 aa  220  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.76 
 
 		 593 aa  219  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.36 
 
 		 592 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 592 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.96 
 
 		 605 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 592 aa  216  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 588 aa  216  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.37 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.94 
 
 		 599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  31.13 
 
 		 591 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.9 
 
 		 591 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.99 
 
 		 613 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  30.54 
 
 		 587 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  27.76 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.87 
 
 		 605 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  26.85 
 
 		 609 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.32 
 
 		 605 aa  207  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 		 590 aa  206  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  28.13 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  28.42 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.7 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  28.42 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  28.13 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 		 588 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  27.15 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  27.06 
 
 		 590 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.8 
 
 		 593 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.33 
 
 		 609 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  27.11 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  25.96 
 
 		 611 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  28.3 
 
 		 609 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  27.04 
 
 		 612 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  28.37 
 
 		 634 aa  194  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  29.17 
 
 		 591 aa  194  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  25.88 
 
 		 588 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  28.8 
 
 		 590 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  26.45 
 
 		 609 aa  193  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  28.62 
 
 		 590 aa  193  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.45 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.33 
 
 		 610 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.33 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.97 
 
 		 610 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  26.33 
 
 		 609 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  29.2 
 
 		 622 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.33 
 
 		 610 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  26.1 
 
 		 588 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.16 
 
 		 610 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  26.52 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  25.78 
 
 		 610 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.32 
 
 		 621 aa  189  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  26.94 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  26.5 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.14 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  26.94 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  26.5 
 
 		 609 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  31.58 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>