More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1390 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  100 
 
 		 581 aa  1105    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  46.85 
 
 		 592 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  44.6 
 
 		 596 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  38.96 
 
 		 588 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  43.87 
 
 		 609 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  42.81 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  36.67 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  43.31 
 
 		 609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  36.18 
 
 		 596 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  35.84 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  35.15 
 
 		 602 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  35.15 
 
 		 596 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  34.64 
 
 		 597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  37.09 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  37.37 
 
 		 588 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.76 
 
 		 598 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  35.93 
 
 		 592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  36.79 
 
 		 612 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  36.97 
 
 		 588 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  37.59 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  35.25 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.33 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 		 592 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  35.88 
 
 		 592 aa  300  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  36.36 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.24 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.29 
 
 		 622 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  35.86 
 
 		 592 aa  293  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  35.86 
 
 		 592 aa  293  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  35.28 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.99 
 
 		 589 aa  289  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.27 
 
 		 613 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.28 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  36.25 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.13 
 
 		 593 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.97 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  37.7 
 
 		 591 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  32.79 
 
 		 619 aa  279  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 607 aa  274  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  35.59 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.31 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  32.45 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  32.28 
 
 		 630 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  32.28 
 
 		 610 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 		 593 aa  269  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  35.03 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  35.62 
 
 		 599 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  35.28 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  32.24 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.59 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.66 
 
 		 602 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  32.95 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  32.9 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  32.9 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  32.9 
 
 		 608 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  32.24 
 
 		 610 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  32.9 
 
 		 608 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  32.9 
 
 		 608 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  32.73 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  32.24 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  32.24 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  32.24 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.24 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  32.24 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  32.28 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  35.89 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.36 
 
 		 602 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.24 
 
 		 610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  32.08 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.36 
 
 		 602 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  32.11 
 
 		 611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.39 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.48 
 
 		 594 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  32.34 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  32.34 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  33.33 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  32.22 
 
 		 605 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  35.03 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  32.54 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.22 
 
 		 627 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  33.99 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  34.04 
 
 		 605 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  31.93 
 
 		 591 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 591 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  33.17 
 
 		 616 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  33.39 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  32.3 
 
 		 611 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  32.32 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  32.06 
 
 		 604 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  31.57 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  32.49 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  33.62 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  34.19 
 
 		 632 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 		 593 aa  246  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  32.34 
 
 		 619 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  33.84 
 
 		 609 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.26 
 
 		 590 aa  246  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.31 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.78 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>