More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4408 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  64.6 
 
 
596 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  100 
 
 
596 aa  1178    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  64.43 
 
 
602 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  98.99 
 
 
596 aa  1168    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  63.78 
 
 
597 aa  792    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  41.21 
 
 
622 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  42.61 
 
 
623 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  38.42 
 
 
605 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  38.42 
 
 
605 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  40.38 
 
 
627 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  39.06 
 
 
605 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  40.17 
 
 
609 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  38.68 
 
 
601 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  39.02 
 
 
602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  38.85 
 
 
602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  39.79 
 
 
606 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  38.75 
 
 
602 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  40.38 
 
 
602 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  38.39 
 
 
616 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  39.73 
 
 
618 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  36.15 
 
 
588 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  37.69 
 
 
588 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.83 
 
 
609 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.72 
 
 
612 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  37.41 
 
 
596 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  32.15 
 
 
592 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  34.4 
 
 
592 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.85 
 
 
589 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  32.32 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.15 
 
 
592 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  35.6 
 
 
598 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.11 
 
 
592 aa  316  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 
592 aa  312  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.99 
 
 
592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 
592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.18 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.1 
 
 
591 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  35.2 
 
 
624 aa  302  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.93 
 
 
593 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.06 
 
 
588 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.44 
 
 
593 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.62 
 
 
592 aa  299  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  32.48 
 
 
596 aa  297  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.34 
 
 
619 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.55 
 
 
613 aa  293  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 
588 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.86 
 
 
599 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.9 
 
 
591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.33 
 
 
589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  32.45 
 
 
616 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.94 
 
 
588 aa  280  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 
588 aa  280  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.81 
 
 
606 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  35.6 
 
 
587 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 
608 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 
588 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 
607 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.26 
 
 
610 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.26 
 
 
630 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.26 
 
 
610 aa  263  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.43 
 
 
594 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  30.02 
 
 
588 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.97 
 
 
609 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.08 
 
 
599 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 
618 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.48 
 
 
609 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.78 
 
 
605 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.95 
 
 
634 aa  258  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  28.13 
 
 
611 aa  258  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.06 
 
 
610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 
613 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.59 
 
 
611 aa  252  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  31.78 
 
 
610 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.15 
 
 
610 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.36 
 
 
609 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  30.61 
 
 
596 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.9 
 
 
588 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.01 
 
 
619 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.17 
 
 
593 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.33 
 
 
588 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  28.39 
 
 
613 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.03 
 
 
609 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.38 
 
 
610 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.67 
 
 
609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.12 
 
 
590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  31.39 
 
 
627 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.15 
 
 
610 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  30.56 
 
 
591 aa  243  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.9 
 
 
583 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  28.77 
 
 
590 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  28.22 
 
 
608 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.76 
 
 
614 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 
590 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  28.38 
 
 
608 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.15 
 
 
610 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  28.38 
 
 
608 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  27.15 
 
 
610 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.15 
 
 
610 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  27.15 
 
 
610 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  27.15 
 
 
610 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>