More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1941 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  74.4 
 
 		 627 aa  859    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 623 aa  1218    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  57.36 
 
 		 622 aa  692    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  54.1 
 
 		 618 aa  567  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  46.12 
 
 		 616 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  40.42 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  40.26 
 
 		 602 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  44.56 
 
 		 597 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  42.61 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  42.61 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  39.58 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  36.53 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.36 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.81 
 
 		 605 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.81 
 
 		 605 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  37.99 
 
 		 609 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 		 592 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  36.6 
 
 		 601 aa  331  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.93 
 
 		 596 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  34.18 
 
 		 612 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  35.78 
 
 		 605 aa  317  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.92 
 
 		 609 aa  316  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 593 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  36.17 
 
 		 606 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  36.33 
 
 		 592 aa  313  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  36.41 
 
 		 606 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  35.82 
 
 		 602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  35.53 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  34.7 
 
 		 602 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  34.52 
 
 		 602 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.76 
 
 		 593 aa  296  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.8 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  35.8 
 
 		 613 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.62 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  32.45 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  34.05 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.33 
 
 		 592 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.48 
 
 		 588 aa  290  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 592 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.61 
 
 		 605 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.16 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.45 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  32.49 
 
 		 594 aa  276  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  35.71 
 
 		 591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.53 
 
 		 587 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.01 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.68 
 
 		 609 aa  273  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 588 aa  273  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33.49 
 
 		 592 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.86 
 
 		 589 aa  273  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 592 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  31.8 
 
 		 612 aa  273  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  34.31 
 
 		 588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  33.51 
 
 		 614 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.93 
 
 		 609 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.62 
 
 		 608 aa  267  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.85 
 
 		 609 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  30.33 
 
 		 620 aa  263  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.65 
 
 		 581 aa  263  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.85 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 593 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.68 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.78 
 
 		 613 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.89 
 
 		 588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  32.92 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.39 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  32.92 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.07 
 
 		 609 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.36 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  32.25 
 
 		 641 aa  257  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.35 
 
 		 619 aa  256  8e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  29.15 
 
 		 593 aa  254  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.14 
 
 		 616 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  32.56 
 
 		 591 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  30.49 
 
 		 596 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.33 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  33.63 
 
 		 591 aa  252  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  33.57 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.79 
 
 		 632 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.73 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.26 
 
 		 610 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 619 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.18 
 
 		 610 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.21 
 
 		 590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.18 
 
 		 630 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 590 aa  244  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.31 
 
 		 611 aa  244  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  32.04 
 
 		 587 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.45 
 
 		 608 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.03 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  28.18 
 
 		 650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.6 
 
 		 591 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  30.86 
 
 		 590 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  31.65 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>