More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1895 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  73.06 
 
 		 591 aa  821    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  100 
 
 		 591 aa  1154    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  73.36 
 
 		 592 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  51.69 
 
 		 590 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  44.5 
 
 		 593 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  44.74 
 
 		 606 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  44.46 
 
 		 632 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  42.21 
 
 		 593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  43.82 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  42.21 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  41.71 
 
 		 620 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  40.54 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  42.21 
 
 		 593 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  42.01 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  42.67 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  41.21 
 
 		 593 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  36.93 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  36.52 
 
 		 590 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  35.92 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  39.77 
 
 		 591 aa  389  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  36.63 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  36.59 
 
 		 591 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  37.42 
 
 		 590 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  37.08 
 
 		 590 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  38.01 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  36.59 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  37.94 
 
 		 586 aa  363  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  36.58 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  37.56 
 
 		 591 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  40.37 
 
 		 584 aa  319  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.4 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 		 602 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.14 
 
 		 596 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.46 
 
 		 613 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.39 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.63 
 
 		 623 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.03 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.85 
 
 		 596 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.59 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.83 
 
 		 593 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.14 
 
 		 622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.8 
 
 		 627 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 618 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.61 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.24 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  29.53 
 
 		 592 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.68 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.84 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.16 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.98 
 
 		 607 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.63 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 		 588 aa  230  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  30.2 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.78 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.27 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.42 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31.42 
 
 		 588 aa  227  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.2 
 
 		 609 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  31.1 
 
 		 596 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.67 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.65 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  30.63 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.74 
 
 		 630 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.53 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.74 
 
 		 610 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.05 
 
 		 605 aa  223  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.19 
 
 		 609 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 		 608 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  31.05 
 
 		 581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.57 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  29.29 
 
 		 580 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.69 
 
 		 589 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.92 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.2 
 
 		 609 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.39 
 
 		 611 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 613 aa  216  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.21 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.2 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.06 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.38 
 
 		 610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.16 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  28.62 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.7 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.63 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  29.95 
 
 		 610 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  29.22 
 
 		 609 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  30.88 
 
 		 592 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 592 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  31.01 
 
 		 610 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.47 
 
 		 605 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.03 
 
 		 599 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  31.01 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.16 
 
 		 620 aa  206  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.77 
 
 		 605 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  27.33 
 
 		 624 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  28.62 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>