More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3475 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  68.98 
 
 		 587 aa  736    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  100 
 
 		 591 aa  1149    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  58.28 
 
 		 593 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  61.72 
 
 		 591 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  53.64 
 
 		 591 aa  608  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  57.84 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  55.33 
 
 		 588 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  55.16 
 
 		 588 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  53.89 
 
 		 593 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  53.81 
 
 		 586 aa  581  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  54.15 
 
 		 590 aa  555  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  53.3 
 
 		 590 aa  548  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  52.81 
 
 		 619 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  48.23 
 
 		 594 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  40.6 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  37.65 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  37.44 
 
 		 593 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  39.23 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  36.97 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  37.65 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  39.8 
 
 		 606 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  40.46 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  38.26 
 
 		 605 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  35.51 
 
 		 590 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  38.45 
 
 		 614 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  35.42 
 
 		 620 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  36.38 
 
 		 591 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  36.18 
 
 		 641 aa  342  9e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  37.56 
 
 		 591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  35.51 
 
 		 592 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.78 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.26 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.93 
 
 		 602 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  35.77 
 
 		 584 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.7 
 
 		 597 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.05 
 
 		 613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.73 
 
 		 622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.5 
 
 		 581 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  32.2 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.51 
 
 		 623 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.28 
 
 		 612 aa  243  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  33.69 
 
 		 580 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  33.99 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.23 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.36 
 
 		 598 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.5 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.5 
 
 		 596 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.27 
 
 		 627 aa  230  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.11 
 
 		 619 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.46 
 
 		 588 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.02 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.72 
 
 		 592 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.93 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.49 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.93 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.29 
 
 		 589 aa  220  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 599 aa  220  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.76 
 
 		 610 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 		 588 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.77 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.46 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  30.45 
 
 		 600 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.38 
 
 		 620 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.55 
 
 		 621 aa  214  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.3 
 
 		 609 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.58 
 
 		 610 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  28.83 
 
 		 605 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.4 
 
 		 593 aa  213  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.15 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.3 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.54 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.48 
 
 		 592 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.48 
 
 		 592 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.05 
 
 		 616 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.58 
 
 		 610 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.19 
 
 		 601 aa  209  9e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.76 
 
 		 588 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 592 aa  207  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.89 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 588 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.05 
 
 		 592 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.07 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.9 
 
 		 608 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.11 
 
 		 609 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.67 
 
 		 609 aa  203  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.43 
 
 		 610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  28.36 
 
 		 610 aa  200  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.16 
 
 		 602 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  29.49 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  28.29 
 
 		 612 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.03 
 
 		 602 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  28.5 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  27.95 
 
 		 592 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  28.34 
 
 		 611 aa  196  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>