More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5704 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  58.54 
 
 		 591 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  61.33 
 
 		 619 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  59.18 
 
 		 586 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 588 aa  1167    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  61.69 
 
 		 590 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  61.53 
 
 		 590 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  59.63 
 
 		 593 aa  690    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  95.07 
 
 		 588 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  57.43 
 
 		 593 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  56.18 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  56.08 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  55.16 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  54.16 
 
 		 587 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  48.23 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  40.95 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  39.93 
 
 		 606 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  39.73 
 
 		 593 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  38.41 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  39.39 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  37.28 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  38.4 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  37.61 
 
 		 590 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  39.58 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  38.23 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  38.71 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  37.64 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  36.68 
 
 		 591 aa  364  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  35.29 
 
 		 641 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  37.12 
 
 		 591 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  36.97 
 
 		 592 aa  336  7.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  35.59 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.2 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  33.15 
 
 		 580 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  34.23 
 
 		 581 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.81 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.45 
 
 		 602 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 		 592 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.9 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.88 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.3 
 
 		 619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.53 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.42 
 
 		 592 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  28.36 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  29.46 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.71 
 
 		 593 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.7 
 
 		 605 aa  226  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 592 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.71 
 
 		 621 aa  225  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.07 
 
 		 592 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.05 
 
 		 609 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.75 
 
 		 592 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 592 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.51 
 
 		 592 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.51 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.98 
 
 		 591 aa  220  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.82 
 
 		 623 aa  220  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.93 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.83 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.83 
 
 		 630 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.69 
 
 		 616 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.67 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.54 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.46 
 
 		 605 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.11 
 
 		 618 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.07 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.17 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.27 
 
 		 596 aa  208  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.47 
 
 		 608 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 588 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  28.17 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  28.26 
 
 		 599 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30 
 
 		 588 aa  204  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 608 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 		 613 aa  203  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.57 
 
 		 609 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  27.12 
 
 		 609 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  29.42 
 
 		 581 aa  200  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.72 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  25.44 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.1 
 
 		 609 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  25.94 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  24.71 
 
 		 624 aa  196  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  28.62 
 
 		 616 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  27.91 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.32 
 
 		 610 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  28.89 
 
 		 609 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.32 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  27.49 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.05 
 
 		 589 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.94 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  28.41 
 
 		 589 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  27.76 
 
 		 609 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.35 
 
 		 588 aa  191  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>