More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1175 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  100 
 
 		 589 aa  1179    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  58.57 
 
 		 588 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  57.22 
 
 		 588 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  48.56 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  51.1 
 
 		 588 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 588 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  49.74 
 
 		 587 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  46.26 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  45.73 
 
 		 591 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  41.58 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  45.18 
 
 		 591 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  41.23 
 
 		 622 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  39.62 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  39.19 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  41.73 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  37.29 
 
 		 593 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.79 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.7 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  35.02 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 575 aa  326  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.85 
 
 		 596 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.48 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  33.9 
 
 		 596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  33.73 
 
 		 602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  35.03 
 
 		 593 aa  314  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  35.41 
 
 		 575 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.24 
 
 		 597 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.09 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 		 575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 592 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  38.09 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  36.38 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  34.52 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  34.42 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.88 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.68 
 
 		 592 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  33.56 
 
 		 575 aa  299  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.9 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  34.41 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.01 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.87 
 
 		 574 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.66 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  33.95 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.45 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 574 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  35.6 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  32.88 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.91 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  34.93 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  34.08 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.66 
 
 		 612 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  35.33 
 
 		 574 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.2 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  39.7 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  33.85 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.22 
 
 		 622 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.28 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.07 
 
 		 624 aa  274  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.08 
 
 		 616 aa  273  7e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.24 
 
 		 605 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.62 
 
 		 613 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.41 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  33.1 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.99 
 
 		 581 aa  270  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  36.07 
 
 		 574 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  35.45 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.21 
 
 		 627 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.92 
 
 		 601 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 		 592 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.99 
 
 		 592 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 592 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  35.41 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.95 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  34.58 
 
 		 574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.25 
 
 		 608 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  31.82 
 
 		 610 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.61 
 
 		 609 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  31.82 
 
 		 610 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  31.82 
 
 		 630 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  35.59 
 
 		 574 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  31.8 
 
 		 611 aa  252  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  32.15 
 
 		 609 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  32.02 
 
 		 609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  31.69 
 
 		 602 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  33.28 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.68 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.91 
 
 		 619 aa  244  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.44 
 
 		 609 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  31.53 
 
 		 602 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.81 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.79 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  31.32 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.86 
 
 		 602 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.32 
 
 		 609 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  31.34 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.46 
 
 		 593 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>