283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0799 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  59.76 
 
 
575 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  59.16 
 
 
575 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  60.03 
 
 
575 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  100 
 
 
575 aa  1135    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  57.59 
 
 
575 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  48.87 
 
 
575 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  47.87 
 
 
575 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  46.07 
 
 
574 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  43.55 
 
 
579 aa  445  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  45.63 
 
 
574 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  43.51 
 
 
574 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  46.08 
 
 
574 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  44.99 
 
 
574 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  42.61 
 
 
575 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 
574 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  44.31 
 
 
574 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  44.31 
 
 
574 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  44.77 
 
 
574 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  44.31 
 
 
574 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  44.31 
 
 
574 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  44.83 
 
 
574 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  44.66 
 
 
574 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  44.83 
 
 
574 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  45.32 
 
 
578 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  40.62 
 
 
583 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  37.71 
 
 
591 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
588 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.63 
 
 
588 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.85 
 
 
589 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.15 
 
 
588 aa  286  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  32.83 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  34.23 
 
 
592 aa  283  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.05 
 
 
589 aa  279  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.03 
 
 
591 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.28 
 
 
588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34 
 
 
587 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 
575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 
598 aa  233  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.85 
 
 
597 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.11 
 
 
583 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.32 
 
 
622 aa  220  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 
623 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.15 
 
 
596 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30 
 
 
596 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.33 
 
 
596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.4 
 
 
624 aa  213  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 
592 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.65 
 
 
596 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  28.34 
 
 
605 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.45 
 
 
622 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.47 
 
 
601 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.62 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.05 
 
 
593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.16 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 
588 aa  200  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  26.61 
 
 
602 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  26.61 
 
 
596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.94 
 
 
592 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.94 
 
 
592 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.67 
 
 
602 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.26 
 
 
618 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  28.83 
 
 
634 aa  193  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 
607 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.33 
 
 
602 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.36 
 
 
609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.29 
 
 
599 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  27.42 
 
 
605 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  27.42 
 
 
605 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  27.83 
 
 
606 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.05 
 
 
602 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.15 
 
 
588 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  29.86 
 
 
572 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 
613 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
592 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.34 
 
 
588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.54 
 
 
599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.35 
 
 
619 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  28.16 
 
 
602 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  26.28 
 
 
608 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.57 
 
 
592 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
592 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
605 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  27.31 
 
 
581 aa  166  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  29.5 
 
 
609 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  25.32 
 
 
616 aa  163  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  26.12 
 
 
593 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
591 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.79 
 
 
621 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
593 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  25.13 
 
 
613 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  25.88 
 
 
587 aa  160  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  28.01 
 
 
619 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  25.35 
 
 
616 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  24.6 
 
 
588 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  24.16 
 
 
588 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 
605 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  25.33 
 
 
614 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>