More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1749 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  100 
 
 
593 aa  1179    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.67 
 
 
591 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  37.29 
 
 
589 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  35.39 
 
 
588 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  36.7 
 
 
589 aa  342  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  38.03 
 
 
588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  36.16 
 
 
588 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  35.18 
 
 
592 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  36.22 
 
 
579 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.55 
 
 
588 aa  317  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  35.32 
 
 
587 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  36.44 
 
 
574 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  35.51 
 
 
591 aa  310  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 
574 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  35.46 
 
 
622 aa  306  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  38.04 
 
 
578 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.54 
 
 
583 aa  294  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.33 
 
 
574 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 
575 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 
575 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  35.45 
 
 
575 aa  287  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.11 
 
 
574 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  35.03 
 
 
575 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.67 
 
 
575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 
574 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  35.37 
 
 
575 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34.77 
 
 
583 aa  281  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.14 
 
 
634 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 
575 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 
574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  36.4 
 
 
572 aa  270  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  32.83 
 
 
574 aa  270  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  35.92 
 
 
574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  36.09 
 
 
574 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.03 
 
 
574 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.69 
 
 
598 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  34.15 
 
 
574 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  33.51 
 
 
574 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 
574 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
574 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.62 
 
 
597 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.92 
 
 
596 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.58 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.72 
 
 
596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.55 
 
 
602 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.79 
 
 
622 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.65 
 
 
623 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  32.87 
 
 
575 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  32.02 
 
 
618 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.53 
 
 
605 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.7 
 
 
605 aa  241  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.02 
 
 
601 aa  239  8e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.53 
 
 
605 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 
627 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 
607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.05 
 
 
616 aa  234  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 
588 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.5 
 
 
581 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.93 
 
 
602 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.34 
 
 
609 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.36 
 
 
596 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.85 
 
 
609 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.02 
 
 
602 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.06 
 
 
592 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.7 
 
 
602 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.38 
 
 
602 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.13 
 
 
613 aa  220  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  28.77 
 
 
612 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  27.34 
 
 
588 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.87 
 
 
593 aa  218  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.7 
 
 
606 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.64 
 
 
599 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  26.42 
 
 
588 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 
592 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.4 
 
 
592 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
592 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.42 
 
 
624 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.03 
 
 
620 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 
619 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  27.76 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.31 
 
 
609 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.33 
 
 
592 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 
592 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  27.05 
 
 
586 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  28.45 
 
 
591 aa  193  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  26.43 
 
 
590 aa  193  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.37 
 
 
610 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  27.4 
 
 
596 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  26.93 
 
 
605 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  27.58 
 
 
618 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 
591 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.15 
 
 
588 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.39 
 
 
610 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.26 
 
 
590 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  27.73 
 
 
627 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.39 
 
 
630 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>