More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2058 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  82.76 
 
 		 612 aa  986    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  100 
 
 		 609 aa  1172    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  46.72 
 
 		 613 aa  525  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  42.6 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  42.43 
 
 		 630 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  39.67 
 
 		 619 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  42.6 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  43.49 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  42.43 
 
 		 610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  43.25 
 
 		 621 aa  449  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  43.79 
 
 		 609 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  42.32 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  43.32 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  43.32 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  41.34 
 
 		 610 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  42.69 
 
 		 619 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  41.69 
 
 		 611 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  40.5 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  43.18 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  42.38 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  41.5 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  41.5 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  41.5 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  41.5 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  45.42 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  41.5 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  41.34 
 
 		 610 aa  422  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  40.91 
 
 		 610 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  45.1 
 
 		 610 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  41.5 
 
 		 610 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  41.34 
 
 		 610 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  41.75 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  41.75 
 
 		 608 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  41.75 
 
 		 608 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  41.75 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  41.75 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  47.32 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  41.77 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  42.65 
 
 		 609 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  38.87 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  38.97 
 
 		 627 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  38.25 
 
 		 600 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.81 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.83 
 
 		 596 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  34.33 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.39 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  38.17 
 
 		 592 aa  339  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.41 
 
 		 602 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.41 
 
 		 596 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  36.33 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.69 
 
 		 623 aa  319  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  38.19 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  32.63 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  34.11 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  34.65 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.3 
 
 		 622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.98 
 
 		 627 aa  303  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  34.32 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  34.08 
 
 		 606 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  36.78 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.55 
 
 		 588 aa  290  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.55 
 
 		 593 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.99 
 
 		 589 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.58 
 
 		 616 aa  286  9e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  33.56 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.94 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.36 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  32.63 
 
 		 604 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.78 
 
 		 605 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.43 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  34.17 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  31.45 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  34.43 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  31.96 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.27 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.03 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.8 
 
 		 613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.52 
 
 		 592 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 592 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.71 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30 
 
 		 594 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  31.31 
 
 		 592 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.28 
 
 		 609 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.89 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  31.17 
 
 		 627 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 592 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 593 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  30.41 
 
 		 650 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  30.85 
 
 		 591 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.4 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  31.61 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.09 
 
 		 591 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  30.23 
 
 		 593 aa  256  9e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  31.99 
 
 		 602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>