More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1360 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  100 
 
 
610 aa  1214    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  100 
 
 
610 aa  1214    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  61.02 
 
 
609 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  87.54 
 
 
610 aa  1065    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  90.98 
 
 
608 aa  1097    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  74.63 
 
 
610 aa  903    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  72.3 
 
 
611 aa  885    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  90.98 
 
 
608 aa  1097    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  99.84 
 
 
610 aa  1212    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  73.93 
 
 
619 aa  880    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  99.84 
 
 
610 aa  1213    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  90.82 
 
 
608 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  71.64 
 
 
610 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  61.15 
 
 
610 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  60.53 
 
 
609 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  71.64 
 
 
630 aa  900    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  100 
 
 
610 aa  1214    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  99.67 
 
 
610 aa  1211    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  60.49 
 
 
610 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  71.97 
 
 
610 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1214    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  60.86 
 
 
609 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  72.79 
 
 
610 aa  876    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  99.67 
 
 
610 aa  1212    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  90.98 
 
 
608 aa  1096    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  100 
 
 
610 aa  1214    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  61.02 
 
 
609 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  90.82 
 
 
608 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  70 
 
 
611 aa  881    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  57.82 
 
 
609 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  50.98 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  49.44 
 
 
620 aa  568  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  48.32 
 
 
627 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  43.72 
 
 
613 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  41.5 
 
 
609 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  42.18 
 
 
612 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  37.66 
 
 
619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  37.84 
 
 
616 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  37.46 
 
 
621 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.8 
 
 
588 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  35.69 
 
 
609 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  36.7 
 
 
545 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  34.19 
 
 
600 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 
588 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.25 
 
 
596 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  32.02 
 
 
596 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.32 
 
 
602 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
608 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.08 
 
 
596 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  30.7 
 
 
613 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.65 
 
 
627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 
592 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  32.32 
 
 
612 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.15 
 
 
596 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.09 
 
 
597 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  29.28 
 
 
604 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  32.55 
 
 
605 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.81 
 
 
592 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  30.42 
 
 
595 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.48 
 
 
606 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.34 
 
 
589 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.1 
 
 
588 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.26 
 
 
623 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.24 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  32.75 
 
 
612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  30.31 
 
 
592 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.7 
 
 
594 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 
592 aa  234  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.73 
 
 
622 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 
605 aa  230  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.23 
 
 
588 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.93 
 
 
593 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.11 
 
 
614 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.3 
 
 
604 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.71 
 
 
593 aa  223  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  31.18 
 
 
587 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 
592 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 
598 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.95 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.42 
 
 
599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  27.66 
 
 
650 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 
588 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 
588 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 
593 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 
588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.3 
 
 
632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
608 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
588 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 
591 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 
591 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.48 
 
 
596 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
605 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  28.48 
 
 
589 aa  210  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.25 
 
 
590 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.58 
 
 
590 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.93 
 
 
592 aa  207  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.64 
 
 
618 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  27.96 
 
 
593 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>