More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3469 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  61.44 
 
 
612 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1168    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  45.87 
 
 
604 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  47.8 
 
 
605 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  44.8 
 
 
600 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  38.25 
 
 
609 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.98 
 
 
612 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  33.66 
 
 
613 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  34.38 
 
 
610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  34.2 
 
 
609 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  53.42 
 
 
512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  33.44 
 
 
611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  33.88 
 
 
610 aa  302  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  34.4 
 
 
609 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  34.19 
 
 
610 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  33.82 
 
 
609 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  33.82 
 
 
609 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  34.09 
 
 
610 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  34.21 
 
 
619 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  33.93 
 
 
610 aa  293  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.45 
 
 
619 aa  291  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  31.74 
 
 
610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  34.19 
 
 
610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  31.74 
 
 
630 aa  290  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  31.58 
 
 
610 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  33.33 
 
 
609 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  34.19 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  34.19 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  34.19 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  34.19 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.19 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.57 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.19 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  34.03 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  34.46 
 
 
609 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  33.66 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  32.31 
 
 
616 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  32.85 
 
 
610 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  32.38 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  33.82 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  33.82 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  33.66 
 
 
608 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  33.66 
 
 
608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  33.66 
 
 
608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
593 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  32.63 
 
 
620 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.47 
 
 
605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  33.84 
 
 
627 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  32.41 
 
 
604 aa  239  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.53 
 
 
588 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  33.76 
 
 
545 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  29 
 
 
609 aa  234  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 
588 aa  230  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.35 
 
 
606 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.76 
 
 
588 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.33 
 
 
614 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 
592 aa  227  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.52 
 
 
596 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.71 
 
 
602 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.82 
 
 
632 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.16 
 
 
589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.42 
 
 
623 aa  223  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.41 
 
 
616 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.52 
 
 
597 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.59 
 
 
596 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.46 
 
 
592 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.18 
 
 
594 aa  217  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 
593 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.51 
 
 
622 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 
613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.6 
 
 
627 aa  213  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.72 
 
 
589 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.9 
 
 
608 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 
591 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.86 
 
 
588 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  29.4 
 
 
591 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
598 aa  203  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.77 
 
 
641 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.44 
 
 
593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  28.94 
 
 
591 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  32.84 
 
 
590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.63 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  30.28 
 
 
591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  30.2 
 
 
591 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.47 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  30.78 
 
 
596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.11 
 
 
618 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 
605 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.64 
 
 
593 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  28.55 
 
 
591 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.43 
 
 
590 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
588 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 
588 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.96 
 
 
593 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  31.75 
 
 
590 aa  194  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.6 
 
 
590 aa  193  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
607 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  28.03 
 
 
590 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.82 
 
 
624 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.23 
 
 
593 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>