More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2690 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  100 
 
 		 627 aa  1210    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  57.33 
 
 		 609 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  52.76 
 
 		 620 aa  611  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  55.08 
 
 		 609 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  53.82 
 
 		 609 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  54.33 
 
 		 609 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  54.5 
 
 		 609 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  53.44 
 
 		 610 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  53.61 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  52.12 
 
 		 610 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  49.66 
 
 		 630 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  49.5 
 
 		 610 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  49.66 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  55.02 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  48.43 
 
 		 611 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  48.68 
 
 		 610 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  49.33 
 
 		 610 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  48.36 
 
 		 610 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  48.52 
 
 		 610 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  48.52 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  48.52 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  48.52 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  48.36 
 
 		 610 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  48.52 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  48.52 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  49.33 
 
 		 619 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  49.59 
 
 		 611 aa  538  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  47.93 
 
 		 608 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  47.93 
 
 		 608 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  47.93 
 
 		 608 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  47.93 
 
 		 608 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  47.54 
 
 		 610 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  47.93 
 
 		 608 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  40.46 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  38.01 
 
 		 612 aa  362  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  38.76 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  34.19 
 
 		 619 aa  345  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  36.58 
 
 		 609 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.93 
 
 		 588 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  33.88 
 
 		 616 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  33.66 
 
 		 621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.26 
 
 		 588 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  33.66 
 
 		 600 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.32 
 
 		 602 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.01 
 
 		 596 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  34.19 
 
 		 545 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.7 
 
 		 596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.54 
 
 		 596 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.99 
 
 		 608 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.76 
 
 		 597 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  33.91 
 
 		 612 aa  237  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  32.28 
 
 		 604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 		 605 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.5 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  32.45 
 
 		 605 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.35 
 
 		 592 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.26 
 
 		 596 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.26 
 
 		 589 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.95 
 
 		 622 aa  223  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.46 
 
 		 588 aa  223  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.22 
 
 		 632 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.16 
 
 		 594 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.05 
 
 		 604 aa  218  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.11 
 
 		 605 aa  217  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.52 
 
 		 588 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.19 
 
 		 601 aa  217  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.75 
 
 		 623 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.71 
 
 		 627 aa  216  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.63 
 
 		 598 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  30.45 
 
 		 608 aa  216  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.22 
 
 		 592 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 		 608 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.53 
 
 		 616 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 592 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.18 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  30.06 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.2 
 
 		 591 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  29.31 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.81 
 
 		 609 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.81 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29 
 
 		 624 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.45 
 
 		 593 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  28.88 
 
 		 583 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.27 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.11 
 
 		 592 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.27 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  26.35 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.69 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.69 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  28.42 
 
 		 627 aa  201  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 588 aa  201  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  27.82 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.18 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>