More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2066 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1188    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  41.89 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  39.3 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  39.28 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  39.56 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  39.22 
 
 		 592 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  39.63 
 
 		 592 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  39.22 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  39.46 
 
 		 593 aa  389  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  37.28 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  37.11 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  39.22 
 
 		 599 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  34.72 
 
 		 602 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  34.89 
 
 		 596 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  37.22 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  39.12 
 
 		 592 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  39.12 
 
 		 592 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  39.13 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  37.16 
 
 		 623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  37.23 
 
 		 588 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  35.6 
 
 		 596 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  36.33 
 
 		 589 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  35.1 
 
 		 596 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  36.41 
 
 		 588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  35.34 
 
 		 591 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 		 592 aa  336  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  37.24 
 
 		 627 aa  336  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  35.89 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  37.5 
 
 		 591 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  35.6 
 
 		 622 aa  325  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  36.66 
 
 		 588 aa  321  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  35.65 
 
 		 616 aa  320  5e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  37.69 
 
 		 587 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.21 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  35.53 
 
 		 596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.78 
 
 		 592 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.79 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  35.03 
 
 		 605 aa  296  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.21 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 608 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.33 
 
 		 612 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  37.23 
 
 		 618 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  34.05 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.45 
 
 		 609 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.22 
 
 		 605 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  32.51 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.04 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  34.56 
 
 		 596 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.99 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.2 
 
 		 594 aa  276  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  34.61 
 
 		 606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.65 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.74 
 
 		 601 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  33.71 
 
 		 605 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  33.73 
 
 		 602 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.65 
 
 		 602 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.09 
 
 		 608 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.58 
 
 		 583 aa  270  8e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.72 
 
 		 632 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  34.29 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 593 aa  264  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.4 
 
 		 606 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.28 
 
 		 613 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.98 
 
 		 593 aa  263  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.85 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.85 
 
 		 630 aa  258  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.41 
 
 		 588 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.85 
 
 		 610 aa  257  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.28 
 
 		 619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.19 
 
 		 609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  30.65 
 
 		 622 aa  254  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  31.57 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  31.44 
 
 		 574 aa  253  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.25 
 
 		 610 aa  250  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.31 
 
 		 634 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.14 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.19 
 
 		 590 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.86 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  32.4 
 
 		 593 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  31.34 
 
 		 574 aa  247  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 574 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  34.74 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  28.86 
 
 		 590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.17 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.79 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.91 
 
 		 609 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.21 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.46 
 
 		 610 aa  243  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  30.08 
 
 		 620 aa  243  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  33.83 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.41 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  31.92 
 
 		 574 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  29.26 
 
 		 591 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  29.25 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  29.25 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  29.25 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.25 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>