More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0637 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  58.23 
 
 		 632 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  100 
 
 		 620 aa  1244    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  56.77 
 
 		 614 aa  678    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  53.42 
 
 		 641 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  42.7 
 
 		 593 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  43.91 
 
 		 606 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  42.72 
 
 		 594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  42.24 
 
 		 605 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  40.91 
 
 		 590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  40.91 
 
 		 590 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  39.39 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  38.94 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  38.14 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  39.97 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  37.28 
 
 		 588 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 		 591 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  41.71 
 
 		 591 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  36.82 
 
 		 590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  37.08 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  36.26 
 
 		 593 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  36.92 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  40.54 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  38.66 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  37.02 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  37.34 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  36.61 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  37.96 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 587 aa  359  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 		 594 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  35.42 
 
 		 591 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.05 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.24 
 
 		 602 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.02 
 
 		 588 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.72 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.16 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.19 
 
 		 613 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.09 
 
 		 619 aa  246  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.86 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.77 
 
 		 596 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.94 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.08 
 
 		 598 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.81 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  26.52 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.21 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.64 
 
 		 610 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.34 
 
 		 622 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.64 
 
 		 630 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  27.99 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.46 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.48 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.59 
 
 		 609 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.03 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.69 
 
 		 588 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.5 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.7 
 
 		 618 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.87 
 
 		 608 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.05 
 
 		 618 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  27.13 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  29.73 
 
 		 580 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.37 
 
 		 616 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.97 
 
 		 610 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  26.01 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.77 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.56 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.91 
 
 		 610 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.72 
 
 		 624 aa  216  9e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  28.37 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.38 
 
 		 581 aa  216  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  26.69 
 
 		 599 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  27.79 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  27.86 
 
 		 609 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  26.54 
 
 		 599 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.1 
 
 		 610 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  26.79 
 
 		 611 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  27.29 
 
 		 616 aa  213  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  28.76 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 		 608 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  27.45 
 
 		 592 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  28.5 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.17 
 
 		 592 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 592 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  27.26 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  27.66 
 
 		 621 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.91 
 
 		 610 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  25.49 
 
 		 592 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  28.71 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  28.04 
 
 		 610 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  27.27 
 
 		 600 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.07 
 
 		 610 aa  207  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  27.91 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  27.91 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  27.91 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.91 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  27.91 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>