More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1887 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  57.25 
 
 		 632 aa  683    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  53.42 
 
 		 620 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  100 
 
 		 641 aa  1266    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  56.63 
 
 		 614 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  42.77 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  44.95 
 
 		 606 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  42.99 
 
 		 588 aa  469  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  40.78 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  42.26 
 
 		 605 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  38.85 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  38.69 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  38.46 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  42.21 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  39.29 
 
 		 591 aa  416  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  37.58 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  37.58 
 
 		 590 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  37.71 
 
 		 593 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  35.56 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  37.67 
 
 		 593 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  36.96 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  35.29 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  37.36 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  36.96 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  37.87 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  36.66 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  35.03 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  40.62 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  36.18 
 
 		 591 aa  350  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  36.55 
 
 		 587 aa  349  7e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  35.71 
 
 		 591 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.85 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.31 
 
 		 596 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.16 
 
 		 602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 		 597 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.26 
 
 		 613 aa  263  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 		 584 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.87 
 
 		 623 aa  259  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.63 
 
 		 622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.78 
 
 		 627 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.38 
 
 		 593 aa  253  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.74 
 
 		 596 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.67 
 
 		 591 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.44 
 
 		 592 aa  250  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.98 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 		 588 aa  247  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.11 
 
 		 612 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.46 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.04 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.42 
 
 		 588 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 607 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  31.09 
 
 		 581 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.97 
 
 		 591 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.44 
 
 		 616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.04 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  29.3 
 
 		 599 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  29.52 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  30.73 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.95 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.33 
 
 		 619 aa  232  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.19 
 
 		 605 aa  230  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.49 
 
 		 618 aa  227  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.11 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.59 
 
 		 620 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.59 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.33 
 
 		 610 aa  224  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.38 
 
 		 592 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  30.68 
 
 		 609 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.01 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  28.73 
 
 		 599 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.01 
 
 		 608 aa  217  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  27.4 
 
 		 601 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  26.59 
 
 		 592 aa  217  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  27.89 
 
 		 605 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  27.48 
 
 		 619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  31.37 
 
 		 596 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  27.99 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  27.95 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  28.14 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  28.7 
 
 		 600 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  26.56 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  27.49 
 
 		 610 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  25.47 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.55 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.06 
 
 		 610 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  26.89 
 
 		 609 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.05 
 
 		 630 aa  210  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  26.89 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.94 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.22 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.12 
 
 		 610 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.91 
 
 		 610 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  27.53 
 
 		 611 aa  207  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.09 
 
 		 581 aa  206  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>