More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4056 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  64.9 
 
 		 592 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  100 
 
 		 592 aa  1161    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  59.02 
 
 		 593 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  57.96 
 
 		 592 aa  668    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  64.38 
 
 		 592 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  60.6 
 
 		 599 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  55.74 
 
 		 592 aa  663    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  65.07 
 
 		 592 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1161    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  43.89 
 
 		 596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  41.71 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  38.69 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.12 
 
 		 598 aa  361  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  34.76 
 
 		 624 aa  350  5e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.18 
 
 		 602 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  34.48 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.18 
 
 		 596 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 596 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.99 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.81 
 
 		 588 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  34.52 
 
 		 592 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  34.47 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.06 
 
 		 622 aa  297  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.49 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.99 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.39 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.94 
 
 		 601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.26 
 
 		 609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.86 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 		 588 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.76 
 
 		 593 aa  279  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.55 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.77 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.55 
 
 		 613 aa  276  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.61 
 
 		 605 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.06 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.66 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  33.67 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.27 
 
 		 612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.27 
 
 		 588 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.28 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.69 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.75 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.79 
 
 		 618 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.14 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 		 588 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.96 
 
 		 588 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.39 
 
 		 591 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.47 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.47 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.64 
 
 		 602 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.33 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  29.39 
 
 		 602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.41 
 
 		 588 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.59 
 
 		 614 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  32.57 
 
 		 596 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.57 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  28.83 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.65 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  28.8 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.48 
 
 		 610 aa  236  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.75 
 
 		 605 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.48 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.55 
 
 		 610 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.35 
 
 		 619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.81 
 
 		 632 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.82 
 
 		 609 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.17 
 
 		 609 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.67 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  29.38 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.88 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.24 
 
 		 593 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.53 
 
 		 609 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.11 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  29.33 
 
 		 590 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.56 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.22 
 
 		 619 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  29.58 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.43 
 
 		 621 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.88 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.27 
 
 		 593 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.19 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.71 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.52 
 
 		 606 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.27 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.22 
 
 		 590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.43 
 
 		 590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  30.09 
 
 		 594 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  30.95 
 
 		 603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.09 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>