More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2621 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  67.52 
 
 
588 aa  802    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  65.96 
 
 
587 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
588 aa  1168    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  54.76 
 
 
588 aa  571  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  50.93 
 
 
589 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  51.53 
 
 
588 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  46.69 
 
 
589 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  47.12 
 
 
588 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  44.44 
 
 
591 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  42.71 
 
 
583 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  42.18 
 
 
592 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  44.52 
 
 
591 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  40.39 
 
 
634 aa  389  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  37.82 
 
 
622 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  37.59 
 
 
572 aa  332  9e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  37.05 
 
 
593 aa  327  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  35.81 
 
 
574 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.76 
 
 
597 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 
588 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.05 
 
 
598 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.23 
 
 
588 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  34.82 
 
 
575 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  37.16 
 
 
574 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  37.41 
 
 
574 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.56 
 
 
575 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.27 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  34.55 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  38.07 
 
 
574 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 
575 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.06 
 
 
596 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  35.47 
 
 
574 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  35.12 
 
 
579 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  33.51 
 
 
596 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  33.75 
 
 
602 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  33.28 
 
 
575 aa  296  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.08 
 
 
622 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.67 
 
 
596 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.8 
 
 
623 aa  294  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 
574 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  34.92 
 
 
608 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.93 
 
 
574 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.97 
 
 
599 aa  287  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.32 
 
 
581 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  36.27 
 
 
616 aa  286  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  36.16 
 
 
627 aa  286  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 
607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  35.6 
 
 
574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  33.55 
 
 
609 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  34.01 
 
 
575 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 
574 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 
574 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.39 
 
 
612 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  35.92 
 
 
613 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  35.46 
 
 
575 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  35.33 
 
 
592 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.72 
 
 
605 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  36.71 
 
 
574 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.55 
 
 
605 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  33.51 
 
 
605 aa  276  8e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  34.34 
 
 
601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 
574 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.03 
 
 
593 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  39.13 
 
 
578 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  35.85 
 
 
574 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  33.22 
 
 
575 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.45 
 
 
609 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34.48 
 
 
583 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.34 
 
 
592 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  36.63 
 
 
574 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.52 
 
 
588 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  33.67 
 
 
596 aa  260  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  34.49 
 
 
619 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.57 
 
 
613 aa  257  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33.57 
 
 
592 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 
592 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.18 
 
 
624 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 
592 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.22 
 
 
592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 
593 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.85 
 
 
606 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.22 
 
 
592 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.4 
 
 
618 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.73 
 
 
602 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  31.04 
 
 
610 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  32.3 
 
 
602 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.52 
 
 
630 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  30.5 
 
 
602 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.87 
 
 
610 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.55 
 
 
602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  35.44 
 
 
599 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.2 
 
 
594 aa  243  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  32.01 
 
 
592 aa  243  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.82 
 
 
609 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.76 
 
 
632 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.77 
 
 
609 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.76 
 
 
609 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.21 
 
 
608 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.14 
 
 
610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.61 
 
 
611 aa  231  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 
605 aa  230  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>